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Le Nutri-Score est encore facultatif, mais sa popularité pour aider les consommateurs à manger sainement, pourrait le rendre obligatoire. Cela inquiète certains producteurs, car certains produits comme le fromageou les saucisses, ne sont pas les plus recommandés nutritionnellement.
Le comté, le Mont d'Or et la saucisse de Morteau sont trois stars du terroir bientôt affublées du bonnet d'âne. La couleur du Nutri-Score pour ces aliments devrait se rapprocher du rouge. Pour le représentant de la filière Mont d'Or, mettre dans le même panier le Mont d'Or et un vulgaire soda est inadmissible : "On travaille sans aliment OGM, on travaille avec de l'herbe et du foin. On ne travaille pas avec des éléments fermentés. Nos produits ne contiennent aucun conservateur ni colorant."