L'hippocampe se nourrit de zooplancton qu'il aspire avec sa bouche minuscule en forme de pipette. Il vit sur le fond et s'accroche aux algues grâce à sa queue préhensile.
Ce petit poisson vit à proximité des prairies de zostères ou de posidonies. Ces herbiers sous-marins sont de vraies réserves de biodiversité qu'il faut préserver.